Pada awal tahun 2000, Pemerintah Kabupaten Bengkalis, melalui Yayasan
Gema Bahari mendirikan perguruan tinggi dengan nama Politeknik Perkapalan
Bengkalis, yang mempunyai 3 (tiga) program studi, yaitu: Teknik Listrik Kapal,
Teknik Bangunan Kapal, dan Teknik Permesinan Kapal. Dalam perjalanannya,
Politeknik Perkapalan Bengkalis berubah nama menjadi Politeknik Bengkalis dan
berada di bawah Yayasan Bangun Insani (YBI) Bengkalis, dengan 5 (lima) program
studi yaitu: Teknik Perkapalan,Teknik Mesin, Teknik Elektro, Teknik Sipil, dan
Administrasi Bisnis.
ada bulan Juli 2001, Politeknik Bengkalis menerima mahasiswa baru
angkatan pertama. Tahun 2006, Politeknik Bengkalis menambah 2 (dua) program
studi baru, yaitu Bahasa Inggris Bisnis dan Teknik Informatika.
Pada awal 2008 Politeknik Bengkalis meminta dukungan kepada YBI
Bengkalis,Pemerintah Kabupaten Bengkalis dan Dewan Perwakilan Rakyat Daerah
Kabupaten Bengkalis untuk mengusulkan peningkatan status dari Perguruan Tinggi
Swasta (PTS) menjadi Perguruan TinggiNegeri (PTN).
Tahun 2009, Politeknik Bengkalis bersama YBI Bengkalis dan Pemerintah
Kabupaten Bengkalis mengusulkan peningkatan status dari PTS menjadi PTN kepada
Kementerian PendidikanNasional melalui Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi
Pada tanggal 9 Februari 2011 Politeknik Bengkalis bersama YBI Bengkalis
dan Pemerintah Kabupaten Bengkalis presentasi ke Menteri Pendayagunaan Aparatur
Negara dan Reformasi Birokrasi guna melengkapi kelayakan penegerian Politeknik
Bengkalis.
Pada tanggal 29 Juli 2011, Politeknik Bengkalis resmi menjadi PTN
dengan nama Politeknik Negeri Bengkalis melalui Peraturan Menteri Pendidikan
Nasional (Permendiknas) No. 28 tahun 2011 tentang Pendirian, Organisasi dan
Tata Kerja Politeknik Negeri Bengkalis.
Pada tanggal 26 Desember 2011, Politeknik Negeri Bengkalis diresmikan
oleh Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia.
Pada tahun 2013 Politeknik Negeri Bengkalis menambah 2 prodi baru yaitu
D4 (Teknik Mesin produksi dan Perawatan dan Teknik listrik) dan 3 prodi D2
(Teknik Pengelasan, Teknik Sistem Pembangkit Tenaga Listrik dan Komputer
Akutansi) yang merupakan Program Studi Diluar Domisili (PDD).
Pada tahun 2014 dan 2015, Politeknik Negeri Bengkalis menambah 2 prodi
baru yaitu D4 (Teknik Perancangan Jalan & Jembatan) dan D3 ( Nautika,
Teknika & Ketatalaksanaan dan Pelabuhan Niaga)
Pada tahun 2016 Politeknik Negeri Bengkalis menambah beberapa prodi
yaitu D4 ( rekayasa Perangkat Lunak, Administrasi Bisnis Internasional dan
Akuntansi Keuangan Public) .
Saat ini 2024, Politeknik Negeri Bengkalis telah memiliki 9 Jurusan, 21
Program Studi.