SMK Pelayaran Jakarta berdiri di bawah badan hukum Yayasan Bahari Sejati. Berdiri pada tanggal 3 Februari 1973 atas dasar kebutuhan tenaga kerja pelaut yang di butuhkan oleh dunia Maritim.
SMK Pelayaran Jakarta berada di bawah dua departemen, yaitu Departemen Pendidikan, kebudayaan, riset dan teknologi dan Departemen Perhubungan laut. SMK Pelayaran Jakarta sudah mengimplementasikan Kurikulum Merdeka dengan struktur kurikulum yang sudah sesuai dengan Peraturan Kementrian Perhubungan Laut no 07 dan Silabus yang sudah sesuai dengan STCW Amanden 2010 khusus untuk Konsentrasi Nautika Kapal Niaga nya kami mengambilnya dari Model Course 703 yang kami padu padankan Capaian Pembelajarannya yang terdapat pada Undang – undang Kemendikbud Ristek no 033.
SMK Pelayaran Jakarta terakreditasi A Unggul dan sudah di Approval, artinya sekolah kami lulusannya layak untuk mendapatkan dua ijasah, yaitu Ijasah Sekolah Menengah Kejuruan yang di keluarkan Kemendiknas dan Sertifikat Ahli Nautika Tingkat IV yang di keluarkan oleh Kemenhub.
Prestasi yang kami raih adalah kami SMK Pelayaran pertama yang manajemennya mendapatkan ISO 9001 : 2015 dan ISO 21001 : 2018 .